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數(shù)字化時(shí)代,信息化育種的實(shí)施步驟和要點(diǎn)

   日期:2021-09-24     來源:農(nóng)業(yè)大數(shù)據(jù)資訊    瀏覽:1687    
核心提示:中國種業(yè)正面臨,前所未有的機(jī)遇與挑戰(zhàn)。隨著第四次工業(yè)革命的進(jìn)行,數(shù)字化時(shí)代即將來臨。數(shù)字計(jì)算機(jī)應(yīng)用,已經(jīng)輻射到種植行業(yè)。本文以促進(jìn)育種效率提升,解決信息化育種存在的主要問題,規(guī)劃出可行的信息化育種實(shí)施策略為研究重點(diǎn)。
       中國種業(yè)正面臨,前所未有的機(jī)遇與挑戰(zhàn)。隨著第四次工業(yè)革命的進(jìn)行,數(shù)字化時(shí)代即將來臨。數(shù)字計(jì)算機(jī)應(yīng)用,已經(jīng)輻射到種植行業(yè)。

       能否完成數(shù)字化轉(zhuǎn)化工作,成為未來發(fā)展的重要影響因素。電子計(jì)算機(jī)和生物工程的發(fā)明和應(yīng)用,是人類文明第三次科技革命的主要標(biāo)志。

       現(xiàn)代信息技術(shù)和生物技術(shù),是構(gòu)建現(xiàn)代化作物育種平臺(tái)的根本方法。大數(shù)據(jù)是與材料和能源一樣,重要的新型戰(zhàn)略資源。信息化是育種的主流趨勢(shì)和必然選擇。

       而信息化育種平臺(tái)較少,嚴(yán)重制約了中國現(xiàn)代種業(yè)的發(fā)展。在大數(shù)據(jù)背景下,推動(dòng)作物育種由3.0時(shí)代的設(shè)計(jì)育種,轉(zhuǎn)變?yōu)?.0時(shí)代的信息化育種。這是農(nóng)業(yè)育種機(jī)構(gòu),近期面臨的關(guān)鍵問題。

數(shù)字化時(shí)代,信息化育種的實(shí)施步驟和要點(diǎn)

       本文以促進(jìn)育種效率提升,解決信息化育種存在的主要問題,規(guī)劃出可行的信息化育種實(shí)施策略為研究重點(diǎn)。

一、信息化在育種中的應(yīng)用

       1、種質(zhì)資源管理

       種質(zhì)資源管理工作,對(duì)于作物育種來說是一項(xiàng)基礎(chǔ)性工作。傳統(tǒng)種質(zhì)資源管理耗費(fèi)大量人力物力。信息數(shù)據(jù)收集緩慢。且資源庫信息傳遞,易受種質(zhì)管理人員流動(dòng)的影響。

       采用信息技術(shù)對(duì)種質(zhì)資源進(jìn)行管理,可以實(shí)現(xiàn)種質(zhì)資源快速查詢、高效利用。上海農(nóng)業(yè)生物基因中心建立的種質(zhì)資源庫管理信息系統(tǒng),為農(nóng)作物準(zhǔn)入、品種權(quán)執(zhí)法提供技術(shù)支撐。

       2、數(shù)據(jù)采集

       育種親本性狀調(diào)查與比較、后代室內(nèi)考種,以及實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)等各個(gè)環(huán)節(jié),都要大量采集數(shù)據(jù)。傳統(tǒng)數(shù)據(jù)獲取的方法勞動(dòng)強(qiáng)度大、時(shí)間長、操作要求高,易受主觀因素影響,限制育種規(guī)模化發(fā)展。

       傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)采集方式,在短時(shí)間內(nèi)很難準(zhǔn)確對(duì)試驗(yàn)點(diǎn)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析和比較。目前許多國家已開始將現(xiàn)代信息技術(shù)、傳感技術(shù)、自動(dòng)化技術(shù),應(yīng)用到育種中。

       并開發(fā)出一系列,適用于育種環(huán)節(jié)的智能檢測(cè)輔助儀器設(shè)備。依托信息化智能化產(chǎn)品設(shè)備,可以減少勞動(dòng)強(qiáng)度、降低投入成本。

       提高育種效率,加速育種進(jìn)程。同時(shí)數(shù)字圖像處理技術(shù)在病害診斷、子粒發(fā)芽監(jiān)測(cè)等方面,應(yīng)用日益廣泛。采用先進(jìn)的圖像掃描技術(shù),可以準(zhǔn)確地獲得農(nóng)作物的形貌特征數(shù)據(jù)。

       3、系譜分析

       近年審定農(nóng)作物品種,普遍存在遺傳背景狹窄、遺傳多樣性不夠豐富的問題。多數(shù)品種親緣關(guān)系較近,在育種中迫切需要引入新的種質(zhì)資源,拓寬遺傳背景。

       系譜圖記載了家族各世代成員及親屬關(guān)系,是指導(dǎo)雜交育種和親本選配的基礎(chǔ)信息。在傳統(tǒng)育種中,系譜圖通過手繪或普通電腦作圖軟件查詢繪制,繁瑣且費(fèi)時(shí)費(fèi)力。

       利用信息化數(shù)據(jù)設(shè)計(jì)系譜圖繪制軟件,可快速輕松獲得系譜圖,為雜交育種和親本選配提供詳細(xì)資料。

       4、試驗(yàn)設(shè)計(jì)

       常用的數(shù)理統(tǒng)計(jì)軟件如 DPS、SPSS、SAS 等,已具備試驗(yàn)設(shè)計(jì)功能。Design Expert等專業(yè)試驗(yàn)設(shè)計(jì)軟件,可通過兩級(jí)因子篩選設(shè)計(jì)、一般因子研究、混合物設(shè)計(jì)技術(shù)以及分割圖設(shè)計(jì)和分析等功能,幫助操作者提高試驗(yàn)速率。

       5、參試進(jìn)程管理

       農(nóng)作物品種審定,需要經(jīng)過申請(qǐng)和受理、品種試驗(yàn)、審定與公告等環(huán)節(jié)。其中品種試驗(yàn)包括區(qū)域試驗(yàn)、生產(chǎn)試驗(yàn)和DUS測(cè)試3部分。

       對(duì)于育種單位來說,品種參試步驟繁多,且涉及知識(shí)產(chǎn)權(quán)責(zé)任重大。所以進(jìn)程管理,變得十分重要。近年來隨著改革的深入,國家農(nóng)業(yè)部門拓寬了試驗(yàn)渠道、簡化了試驗(yàn)程序、縮短了試驗(yàn)審定時(shí)間。

       面對(duì)諸多的作物類型和大量涌現(xiàn)的新品系,迫切需要專業(yè)的信息化平臺(tái),對(duì)品系參試進(jìn)程進(jìn)行記錄、審核、跟蹤管理。

二、信息化育種實(shí)施步驟和要點(diǎn)

       1、育種軟件的應(yīng)用和軟件開發(fā)

       國際種業(yè)巨頭紛紛采用現(xiàn)代信息技術(shù)開展智能育種,加快“經(jīng)驗(yàn)育種”向“精確育種”的轉(zhuǎn)變。目前市場(chǎng)上的主流商業(yè)化育種軟件產(chǎn)品有10余種。

       國內(nèi)僅有金種子育種平臺(tái)和農(nóng)博士兩款。托普云農(nóng)公司開發(fā)的種質(zhì)資源庫管理系統(tǒng)(TPZY-CV2.0),主要用于作物種質(zhì)及中間材料等種質(zhì)資源的信息化管理。

       作為育種機(jī)構(gòu),目前可以先引進(jìn)一些有成功案例的育種軟件,或信息管理系統(tǒng)進(jìn)行應(yīng)用。例如農(nóng)博士育種家軟件V1.0、數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)及條碼打印機(jī)。

       僅需16萬元左右就可以完成單個(gè)作物育種課題組的信息化育種管理。在今后可以根據(jù)實(shí)際需要,利用R語言等開源軟件,設(shè)計(jì)和開發(fā)有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的育種軟件和數(shù)據(jù)平臺(tái)。

       2、管理規(guī)范化與流程信息化相互促進(jìn)

       無論是育種企業(yè)還是政府育種機(jī)構(gòu),行政管理規(guī)范化都是促進(jìn)信息化的有效手段。例如在育種品系參試申報(bào)和植物新品種保護(hù)申報(bào)過程中,都需要加蓋單位公章。

       在這個(gè)過程中,可以將信息化的工作落實(shí)到各育種課題,保證所有簽批事項(xiàng)中所涉及的信息均已錄入信息管理系統(tǒng)。從品種試驗(yàn)信息管理,到種質(zhì)資源庫管理再到產(chǎn)業(yè)化跟蹤管理循序漸進(jìn),實(shí)現(xiàn)作物育種全流程信息化。

       3、信息化人才的引進(jìn)和培養(yǎng)

       作物育種信息化的實(shí)施,需要有既懂作物育種又懂計(jì)算機(jī)科學(xué)的復(fù)合型人才。在對(duì)育種信息進(jìn)行采集和整理的過程中,能夠熟練使用育種軟件。

       并且還需要實(shí)現(xiàn)各種自動(dòng)化采集設(shè)備的數(shù)據(jù)對(duì)接。目前多數(shù)應(yīng)用型農(nóng)業(yè)科研機(jī)構(gòu),缺乏此類復(fù)合型人才。省級(jí)以上科研院所,擁有的生物信息學(xué)專業(yè)人才側(cè)重基礎(chǔ)研究,在品種選育方面缺乏足夠的經(jīng)驗(yàn)。

       因此應(yīng)在今后的人才培養(yǎng)過程中,重視原有育種人員的信息技術(shù)培養(yǎng)。使其在原有育種經(jīng)驗(yàn)的基礎(chǔ)上,能熟練掌握信息化技巧,推進(jìn)信息技術(shù)在作物育種中普及。

       4、信息共享與交流

       數(shù)據(jù)公開、軟件開源與數(shù)據(jù)共享,已經(jīng)成為了科技發(fā)展的重要潮流。為促進(jìn)作物育種創(chuàng)新,育種機(jī)構(gòu)應(yīng)該抓住中國種業(yè)大數(shù)據(jù)平臺(tái)等免費(fèi)數(shù)據(jù)平臺(tái)的利好。

       在品種推廣和知識(shí)產(chǎn)權(quán)保護(hù)方面掌握實(shí)際動(dòng)態(tài)。在育種數(shù)據(jù)資源得到有效保護(hù)和安全管理的前提下,與其他育種機(jī)構(gòu)實(shí)施信息共享與互通。

       隨著傳感器技術(shù)、物聯(lián)網(wǎng)技術(shù)和農(nóng)業(yè)信息服務(wù)技術(shù)的不斷發(fā)展,信息化技術(shù)在育種中的作用日益明顯。通過構(gòu)建信息化種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫,摸清“家底”。

       將親本選擇、材料組配、試驗(yàn)管理、數(shù)據(jù)采集、遺傳分析、產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用等環(huán)節(jié)高效銜接。可以實(shí)現(xiàn)育種全程,數(shù)字化、一體化。與現(xiàn)有育種形式相比,可以節(jié)約資源、降低成本,是構(gòu)建現(xiàn)代化作物育種平臺(tái)的根本途徑。
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